生物质谱研究平台主要基于大量的临床样本，可通过蛋白组、代谢组、核酸分子的定性与定量分析，在队列研究项目中对疾病预防、诊断与治疗提供思路。平台将从以下三个方向进行布局：

　　

　　（1）蛋白质组学

　　建立基于质谱技术的高通量蛋白质组学平台，通过高分辨质谱技术，通过对差异表达的蛋白质进行鉴定、定量、表征，寻找与疾病相关的新标志物，针对不同空间、不同时间上动态变化着的蛋白质组的整体进行比较，分析不同蛋白质组之间蛋白质在表达数量、表达水平和修饰状态上的差异，为人类疾病和健康研究提供新的手段和依据，以及提供疾病治疗和药物开发的靶点。

　　

　　（2）代谢组学

　　组建标准品自建库，建立基于质谱和核磁技术的高通量代谢组学平台，研究基于质谱技术的代谢组学新方法，并将代谢组学技术应用于研究与健康、疾病相关生命医学问题，研究并发展新型质谱方法结合生物信息学实现高通量以及全定量代谢组学技术、建设代谢组学生物信息学平台及代谢物数据库。

　　

　　（3）核酸分子高通量筛查

　　基因检测在遗传性、感染性及肿瘤等疾病的辅助诊断、用药指导等方面起到举足轻重的作用，质谱在该领域的应用使得核酸、蛋白质等生物大分子可通过质谱技术得以检测，极大推进了基因组学、蛋白质组学的发展，并且给生物领域及医学领域带来了革命性的突破。该技术的应用可实现DNA甲基化分析、药物代谢基因突变检测、病原微生物检测及分子分型、CNV基因拷贝数变异分析、易感基因、遗传及肿瘤突变（SNP、INDEL与FUSION等）、DNA/RNA定量分析等。