宏基因组测序-武汉生物样本库有限公司-建设武汉国家级人类遗传资源库

登录注册 EN

首页

科技服务

宏基因组测序

产品描述

案例解析

结果展示

送样须知

Q&A

①技术介绍

宏基因组测序，是对特定环境样品中的微生物群落基因组进行高通量测序，以分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。而所谓宏基因组学就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段，以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法，解读微生物群体多样性与丰度，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。

②技术路线

③技术参数

1.样本要求：

样品类型：环境微生物DNA样品

样品浓度：≥50ng/μ

样品总量：≥3μg

2.测序策略：Illumina/MGI/双端测序

3.测序深度：5-10Gcleandata

4.交付周期：45天

④产品优势

1.提取经验：拥有土壤、粪便、肠道内容物、滤膜等各类环境样本的提取经验;

2.个性化解决方案：除常规分析外，可提供多项高级分析，为您的项目提供最佳解决方案。

富含肥胖的肠道微生物降解肌醇并促进脂质吸收

研究背景
现已有许多研究报告了肠道微生物群在肥胖中的关键作用。然而，导致肥胖的特定微生物及其潜在机制仍未确定。

研究对象

该研究招募了631名肥胖受试者和374名正常体重控制者，对受试者的粪便样本进行了宏基因组测序，确定了肥胖富集的分类菌群；通过小鼠定植试验确定M.rupellensis通过增强肠道脂质吸收来促进肥胖，最后通过体内或体外实验验证M.rupellensis与肥胖之间的因果关系。

研究成果

1.与对照组相比，肥胖者肠道微生物组的α多样性和不同组成显著降低。三种肥胖指标，包括BMI、体重和腰围，被发现与肠道微生物组成显著相关，Megamonas是肥胖中最显著升高的属，且始终与肥胖比例显著较高相关。

2.一系列数据表明M.rupellensis加剧了HFD诱导的肥胖和代谢紊乱，研究者通过转录组测序发现在M.rupellensis定植组中，脂肪消化和吸收途径是上调最多的途径，M.rupellensis通过增强脂质转运和吸收来促进hfd诱导的肥胖。

3.研究者发现M. rupellensis可能通过降解肌醇来促进脂质吸收，

研究结论
对631名肥胖受试者和374名正常体重对照者进行了宏基因组测序，并在肥胖受试者中发现了一个以巨单胞菌为主的肠型样集群。在体外和体内实验中均证实，M. rupellensis具有肌醇降解基因，添加肌醇可有效抑制肠道类器官对脂肪酸的吸收。研究揭示的M. rupellensis可以增强脂质吸收和肥胖，为未来的肥胖管理提供了潜在的策略。

参考文献

Wu C , Yang F , Zhong H ,et al.Obesity-enriched gut microbe degrades myo-inositol and promotes lipid absorption[J].Cell Host & Microbe, 2024, 32(8):24.DOI:10.1016/j.chom.2024.06.012.

粪便
截取样品中段内部粪便样品分装至2mL EP管（无菌）或冻存管（无菌）中，每管粪便量为0.5~2g，数量：2~3管

肠道内容物
挖取内容物分装至2mL EP管（无菌）或冻存管（无菌）中，每管组织量为0.5~2g，数量：2~3管

水体
低微生物含量的清亮水样使用0.22μm滤膜过滤，每个样本至少1L水样；浑浊水样使用0.45μm滤膜过滤，每个样本0.5L-1L水样

拭子
无菌拭子反复擦拭至拭子表面有肉眼可见变化（干燥表面可用生理盐水浸湿拭子），数量：5~10个

注意事项
1.采样过程应尽量避免对样本的干扰，缩短保存和运输时间，使样本尽可能代表自然状态下的微生物原貌，;
2.样本采集后，请尽快将样本置于-80℃保存或液氮速冻保存（拭子样本除外）；
3.为防止样品管在运输过程中受到干冰挤压破裂，最好将冻存样本放到50ml离心管或其他支撑物中，并在支撑物里添加棉花或卫生纸缓冲，干冰运输至实验室。

Q1:.对于宏基因组项目，怎么排除宿主污染？

A1:取样时，尽量不要取靠近组织的部位；可采用相应的去宿主试剂盒提取；若有参考基因组，可通过比对分析去除宿主基因组污染。

Q2:做Meta分析需要有生物学重复吗？

A2:自然环境（土壤、水体、发酵物、食品等）：至少3个生物学重复，推荐5个生物学重复；体内样本（肠道、粪便、口腔拭子、胃组织样等）：个体特异性高，易出现样本偏离，至少3个重复，推荐6-10个重复以上。