单细胞免疫组库测序
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案例解析
结果展示
送样须知
Q&A
①技术介绍
Chromium 单细胞系统平台,可实现高通量的单细胞转录组和单细胞V(D)J测序。不但可以将TCR/BCR双链完美匹配,获得TCR/BCR双链组成情况,而且可以细化到单细胞水平,同时获得5’端转录组信息。
10x Genomics推出的“单细胞免疫谱分析”利用其微流控芯片制备单细胞体系,选择5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集,实现在单细胞水平,对成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)进行全长测序,为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台,对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义。
②技术路线

10x Genomics单细胞免疫组库实验流程
③分析流程

单细胞VDJ免疫组库生信分析流程图
④应用方向
1.抗体的鉴定和新抗体的发现
2.揭示Ig库的发展,绘制全局Ig库
3.研究传染性疾病,如感染发展中的抗体进化谱系等
4.研究免疫失调疾病的V(D)J重组倾向性,寻找免疫失调疾病的生物标记物
5.癌症早期检测、癌症进程和复发诊断的标记物以及肿瘤免疫机制的研究
⑤产品优势
1.项目经验丰富:拥有数百种样本类型单细胞样本处理实操经验,有效保障解离后细胞质量;
2.库型覆盖全面:特异性富集TCR/BCR区域,实现免疫组库信息的无遗漏捕获,结合对罕见细胞类型和特异性生物标志物的有效识别,助力全面解析免疫克隆的多样性特征;
3.流式平台支撑:配套十余年经验的专业流式分选技术团队,可根据客户实验需求对目标免疫细胞进行精准分选与富集,有效剔除杂细胞干扰,大幅提升后续免疫组库测序的数据纯度与结果可靠性。
CCR7的差异表达模式指导肝细胞癌的精准治疗
研究背景:
肝细胞癌(HCC)发病率逐年上升,已成为全球癌症相关死亡的主要原因,且HCC的治疗受到复杂的免疫微环境影响,面临着靶向药物和免疫检查点抑制剂反应率低的挑战。
技术策略:
作者通过使用组织微阵列(TMA)、空间转录组和单细胞测序来识别复杂的肿瘤微环境。

研究成果;
基质细胞中存在CCR7表达,CCR7+免疫细胞向肿瘤间质的浸润增加与肿瘤部位CCL21的高表达相关。
随后,VEGF-C被确定为患者OS较高的独立预测因子,并与CCR7信号传导呈显着正相关。外源性VEGF-C通过激活淋巴血管生成和CCL21/CCR7轴来促进三级淋巴结构(TLS)的形成。因此,VEGF-C治疗增强了抗PD-1免疫疗法的疗效。这项研究强调了肿瘤细胞来源的CCR7表达与基质细胞来源的CCR7表达的相反作用,并指导HCC的精准治疗。
参考文献;
Qin, Jie et al. Differential expression pattern of CC chemokine receptor 7 guides precision treatment of hepatocellular carcinoma. Signal transduction and targeted therapy vol. 10,1 229. 21 Jul. 2025, doi:10.1038/s41392-025-02308-6
单细胞免疫组库测序送样标准
新鲜组织样本
1.取样:选取关注的组织,尽量剔除与实验无关的杂质,组织体积尽量大于5mm3
2.保存:将清洗好的组织放入2~8℃预冷的装有1.5mL组织保存液的2mL冻存管(标明样本编号)中,确保组织完全浸没,置于2~8℃保存。(我司可免费提供组织保存液)
3.运输:将装有组织的冻存管放入自封袋中,用气泡膜包裹,防止样本冻结和运输过程中碰撞损坏,4℃运输。新鲜组织需在离体后48小时内开展实验,请联系销售人员通过快递等方式确保在48小时内送达实验室。
体液及细胞悬液样本
1.取样及保存:
①血液样本取至少4mL,保存在EDTA抗凝管中;
②腹水、胸腔积液等其他体液样本可置于15mL或50mL离心管中;
③细胞系样本保存在细胞培养基中运输;
④制备好的细胞悬液可保存在含10%FBS的细胞培养基中。
2.运输:将样本管用气泡膜包裹,4℃运输,血液、体液和细胞系样本在离体后8小时内送达实验室;制备好的细胞悬液在2小时内送达实验室。
特殊情况
因特殊原因导致不能将样本运输至我司实验室,我司可上门开展实验,客户需提前与销售人员联系,核对《客户实验室物资清单》,签字确认实验室条件满足实验需求,若不满足实验需求,请补充完整后方可上门。
因特殊原因客户需要将动物带至我司实验室现场取样,我司可提供实验场地配合老师开展实验,如有额外试剂耗材需求,请提前联系销售人员。
Q1:Chromium单细胞免疫分析能够实现哪些分析?
A1:该解决方案能够对来自单个细胞的多个类型的数据进行模块化整合,包括基于mRNA的全转录组或靶向基因表达、免疫分型、适应性免疫组库的克隆性和多样性,以及抗原特异性。这种多组学的细胞鉴定方法有助于通过一次实验破译单个细胞的免疫系统规则。
Q2:10x Genomics单细胞免疫组库产品是否可以只进行一种文库类型的建库?
A2:10x Genomics单细胞免疫组库产品建库部分可分为TCR/BCR文库、TCR+BCR文库、TCR/BCR+5’mRNA文库、TCR+BCR+5’mRNA文库几种组合类型,客户可以根据自身研究需求选择所需的建库类型。
Q3:与哪些类型的样本兼容?
A3:Chromium单细胞免疫分析与新鲜或冻存的单细胞悬液兼容。典型的样本包括PBMC、肿瘤浸润淋巴细胞、脾脏、骨髓细胞及其他组织类型。兼容的物种包括人、小鼠、大鼠及其他模式生物。不过,10x Genomics的免疫球蛋白或TCR测序试剂和方案仅支持人和小鼠。
Q4:可以得到全长的可变区吗?
A4:Chromium单细胞免疫分析解决方案利用针对Ig和TCR基因恒定区的基因特异性扩增引物来富集和测序整个V(D)J基因片段。
Q5:是否可以对免疫球蛋白进行分型?
A5:可以,免疫球蛋白的重链序列可分为IgA、IgD、IgE、IgM和IgG。
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