新鲜冰冻组织空间转录组测序-武汉生物样本库有限公司-建设武汉国家级人类遗传资源库

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新鲜冰冻组织空间转录组测序

产品描述

案例解析

结果展示

送样须知

Q&A

①技术介绍

将冰冻组织切片放置在带有spatial barcode的Visium 芯片的捕获区域内，进行HE染色和成像后，通过组织透化，细胞内的mRNA释放，被芯片上带有oligo-dT的探针捕获。被捕获的mRNA开始逆转录，得到的cDNA中包含spatial barcode序列，构建文库后通过测序可以将mRNA转录的序列映射到组织中的原始位置，从而获得基因表达的空间位置信息。

Visium空间转录组的核心在于芯片部分：正式文库构建的芯片上有4个捕获区域，每个捕获区域约含有5,000个spot，每个spot能捕获1～10个细胞，spot与spot中心点之间的距离为100μm，每个spot 含有上百万个可以与mRNA结合的捕获探针，且每个探针上含有独一无二的条形码(spatial barcode)来标记空间位置信息。

空间转录组基因表达芯片原理

②技术路线

1.实验流程

空间转录组测序实验流程

2.分析流程

空间转录组测序分析流程

③应用方向

1.肿瘤异质性

2.组织形态学

3.组织发育机制

4.治疗干预反应

5.生物标志物发现

6.细胞图谱

④产品优势

1.丰富的项目经验：支撑专业的实验操作，最大程度保留组织的原位空间结构与RNA分子完整性，精准获取高保真的空间基因表达数据，真实还原组织微环境的原始状态；
2.完善的技术平台：针对空间转录组服务搭建完善的实验平台和服务团队，从样本冷冻包埋，样本的预处理，建库测序，到数据分析，全环节支撑高质量数据产出；
3.技术体系成熟：技术团队拥有丰富的新鲜冰冻组织实验实操经验，实验流程标准化程度高；实验全程质控留痕、节点可追溯，充分保障检测数据的稳定性与实验结果的可靠性。

解析阿尔茨海默病海马体空间图谱：分子通路解析与诊断新契机
阿尔茨海默病是最常见的痴呆症类型，其主要特征是淀粉样蛋白β（Aβ）斑块和神经原纤维缠结在大脑中的积累，导致脑功能逐渐恶化。长期以来，AD研究依赖小鼠模型。然而，这些模型与阿尔茨海默病患者之间存在显著差异，极大限制了临床转化。为了填补这一研究空白，本研究首次利用全基因组范围且具有单细胞分辨率的空间转录组技术，精准解析了AD患者海马体不同功能分区的细胞组成、基因表达模式及其空间分布。

通过空间转录组测序和单细胞核转录组测序技术，研究者成功绘制了全球首个阿尔茨海默病（AD）患者海马体的单细胞分辨率“时空图谱”，揭示了细胞和功能的变化、淀粉样蛋白微环境及空间病理特征，加深了对AD发病机制的理解。此外，研究者发现携带CCK和PMP2的脑源性外泌体在AD患者的血浆中显著减少，这为临床早期诊断提供了潜在的新生物标志物。

参考文献：

Wang P, Han L, Wang L, et al. Molecular pathways and diagnosis in spatially resolved Alzheimer’s hippocampal atlas[J]. Neuron, 2025.

新鲜冰冻组织空间转录组测序送样标准
样本制备
新鲜组织，必须无坏死、无出血、无钙化、无脂肪过多，适合 Visium 芯片≤6.5 mm × 6.5 mm，厚度2–5 mm。

运输方式
全程干冰运输，填满足量干冰（省内至少 3–5 kg，根据距离调整），全程不能解冻，一旦融化样本即不可用；样本管无RNase、密封、标注清晰。

Q1：可以邮寄速冻组织吗?

A1: 不可以，建议新鲜样本使用OCT包埋好，进行邮寄;如有切片设备，可以切到目的区域后，再进行邮寄。

Q2：样本制备的方法优先选择哪一种?

A2：样本制备选用新鲜的组织材料，“先冻存后包埋”、“先包埋后冻存”两种方法均可。