宏转录组测序-武汉生物样本库有限公司-建设武汉国家级人类遗传资源库

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宏转录组测序

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送样须知

Q&A

①技术介绍

宏转录组学是一门在整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生物全基因组转录情况以及转录调控规律的学科。宏转录组测序，可原位研究特定生境特定时空下微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。结合理化因素的检测，宏转录组可研究多样本间由于理化等指标的差异，时空上不同微生物群落间活跃成分组成的差异分析。

②技术路线

③测序平台：Illumina/MGI PE150

④测序深度：6-12G

⑤交付周期：20个工作日

⑥产品优势

1.样本需求量低：0.5ug建库起始量；
2.高质量数据产出：采用行业主流测序平台，对数据产出、分析流程实施多维度、高标准质控，精准还原微生物群落真实表达状态；
3.定制化分析方案：根据客户项目研究方向与科研目标，除常规基因表达分析，还可以进行物种注释及分类分析，多样品间的比较分析等，适配各类需求场景，为项目提供专业技术支撑。

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宏转录组测序送样标准
样本类型
宏转录组目前仅接收RNA样本，暂不接收组织或环境样本；

RNA质量要求
总量≥1ug；浓度≥50ng/ul；OD260/280=1.8~2.2；无DNA、蛋白/盐离子等严重污染；样本无色透明不粘稠

注意事项
核酸样品建议使用质量好的1.5ml低吸附EP管装载样品，并用封口膜封口。为了防止污染和混乱，请不要使用诸如PCR管、八联管、96孔板或深孔板等非标准管送样，干冰运输至实验室。

Q1：宏转录组一般推荐多少数量?

A1：粪便或肠道内容物，推荐5G数据量；环境类样本比如土壤、水体，推荐10G数据量；组织类等宿主占比较高的样本，推荐至少10G数据量。建议根据研究目的来选择数据量。

Q2：宏转录组生信分析内容中包括物种注释及差异基因分析吗？

A2：包括。在我们的标准分析流程中，包括物种注释及差异基因的分析内容，以及物种与基因两个维度的功能注释。同时，根据不同的分析需求，武汉生物样本库还推出针对于病毒的宏病毒组分析内容，包括已知病毒的鉴定和分析。