TCR/BCR测序

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送样须知

Q&A

①技术介绍
T细胞和B细胞是机体特异性免疫反应中的核心功能细胞,T细胞主要负责介导细胞免疫应答,调节免疫反应的强度和方向,而B细胞主要通过产生抗体来介导体液免疫。这两种细胞对特异性抗原的精准识别,依赖于细胞表面特有的抗原识别受体——T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)。
TCR与BCR的多样性互补决定区(CDR3区)是免疫组研究的核心靶点,其结构多样性直接决定了免疫细胞对不同抗原的识别范围。从分子结构来看,BCR重链与TCR β链包括V(可变区)、D(高变区)、J(连接区)、C(恒定区)四个功能区域;BCR轻链与TCR α链则由V、J、C三个区域组成。TCR与BCR的高度多样性,正是通过V(D)J基因重组与重排过程实现的,这一机制使免疫细胞能够精准识别自然界中广泛存在的各类抗原,为机体提供全面的免疫保护。
当TCR或BCR被特异性抗原激活后,对应的T细胞和B细胞群体将启动克隆增殖反应。下一代测序(NGS)技术能够精准捕获并识别出这些增殖的免疫细胞克隆,通过分析TCR/BCR的克隆扩增,不仅可以在临床上进行精准诊断和动态监测,还可以助力构建标准化免疫组遗传数据库,揭示TCR和BCR的克隆变化与疾病发生、发展与预后的联系,为免疫相关疾病的研究与诊断提供核心技术支撑。

 

②技术路线


③测序策略:NovaSeq6000 PE150


④测序深度:推荐4G


⑤交付周期:20个工作日

 

⑥产品优势

1.低起始量建库:可从低至100ng的RNA或极少量细胞中构建高质量测序文库,大幅降低样本起始量要求,有效打破稀缺、微量样本的测序研究限制;
2.多平台辅助:可流式分选技术提供专业细胞特异性分选前处理,精准提纯目标细胞,大幅提升测序样本纯度与均一性,完美适配高端精准科研研究场景。

通过TCR测序实现鼻咽癌的早期检测
研究背景:
鼻咽癌(NPC)是一种与EB病毒(EBV)高度相关的恶性肿瘤,尤其在华南和东南亚地区高发。由于早期症状不明显,超过80%的患者确诊时已处于中晚期,错过了最佳治疗时机。目前,EBV抗体检测虽用于筛查,但假阳性率高,特异性不足;传统组织活检具有侵入性,而现有影像学方法对早期病灶灵敏度有限。近年来,T细胞受体(TCR)测序技术的发展为癌症早期检测提供了新思路。

 

研究对象:
研究团队对来自中国南方地区的720名受试者(包括228名鼻咽癌患者、241名EBV血清阳性高风险个体和251名血清阴性健康人)进行了外周血TCR的β链深度测序。

 

研究方法:
研究团队基于高通量测序的TCR β链CDR3区域分析技术,对患者外周血中T细胞克隆进行深度测序,通过比对分析,筛选出在鼻咽癌患者中显著富集的208个CDR3 序列,并构建了名为“T-score”的TCR特征评分系统。该评分基于个体TCR repertoire中这些富集序列的数量,实现对鼻咽癌发病风险的量化评估。

 

研究成果:
1.T-score评分系统建立:研究团队鉴定出208个在鼻咽癌患者中显著富集的CDR3 β序列,这些特异性TCR序列在患者组中的平均出现频率达到8.31%,显著高于低风险对照组的2.22%和高风险组的1.9%,基于这些特征性TCR序列研究团队建立了T-score评分系统,T-score显示出很高的风险预测能力。
2.T-score诊断效能验证:通过对34例后来确诊为早期鼻咽癌的志愿者基线血样分析,动态监测数据表明,T-score在确诊前3-12个月就开始显著升高,其预测准确性显著优于传统的VCA-IgA抗体检测,为鼻咽癌的早期预警提供了新的有效手段。
3.抗原特异性发现:研究发现这些TCR既能够靶向EBV抗原,也能够识别非EBV的肿瘤自身抗原。HLA关联分析显示45个TCRβ序列与特定的HLA-I类等位基因显著相关。研究人员通过trogocytosis技术成功鉴定出TCR-ID1识别的具体抗原表位,为免疫治疗应用提供了重要的靶点信息。

                                                                                                           TCR检测鼻咽癌的研究路线

这项研究不仅为鼻咽癌的早期筛查提供了超越传统抗体和ctDNA检测的新思路,其发现的特异性TCR序列本身也具有巨大的免疫治疗潜力,可用于开发TCR-T细胞疗法或癌症疫苗。

 

参考文献:

Zhang S, Zhou Y, Liu Z, et al. Immunosequencing identifies signatures of T cell responses for early detection of nasopharyngeal carcinoma. Cancer Cell. 2025 Aug 11;43(8):1423-1441.e10. doi: 10.1016/j.ccell.2025.04.009. 

TCR/BCR测序送样标准
PBMC
≥ 1×10⁶个细胞 / 样本,细胞活率 ≥ 80%,无明显红细胞、血小板污染,离心沉淀后,去除上清,干冰/液氮速冻寄送,避免反复冻融
 

分选细胞
建议送样量:≥ 2×10⁴ 个细胞/样本,分选纯度越高越好,建议 ≥ 90%,细胞活率 ≥ 85%,离心收集细胞沉淀,去除分选缓冲液,液氮速冻后干冰运输
 

全血样本
根据下游实验分为两类:
≥ 1 mL新鲜全血,EDTA-K₂ 抗凝(禁止肝素)室温运输,24 h内送达并分离PBMC
≥ 1 mL PAXgene Blood RNA Tube,严格按 PAXgene 标准流程采血、颠倒混匀,室温静置2 h后 2–8℃ 暂存,干冰/冰袋运输
 

RNA 样本
≥ 1 μg 总 RNA,浓度 ≥ 50 ng/μL,体积 ≥ 20 μL,RIN 值 ≥ 7.0,28S/18S 条带比 ≥ 1.0,无基因组 DNA 污染,无蛋白、盐离子、乙醇残留。RNA溶液干冰速冻,干冰运输,严禁反复冻融

Q1:免疫组库测序的核心检测区域是什么?为什么重点测该区域?

A1:核心检测TCR/BCR CDR3区,CDR3TCR/BCR与抗原结合的核心功能区,由VDJ基因重排过程中随机拼接、核苷酸插入/缺失形成,具有高度的序列多样性(人类TCRβCDR3多样性可达10¹²以上),是反映免疫组库多样性、克隆型特异性的唯一标识。

 

Q2: 同一份样本多次取样,TCR/BCR结果会有差异吗?

A2:外周血免疫组库存在一定的时间异质性,健康人短期内(1-2 周)取样,多样性指数变异率<10%,优势克隆型无明显变化;疾病状态下,免疫组库会随病情动态变化,多次取样可反映免疫应答的动态过程。

 

Q3:bulk免疫组测序和单细胞免疫组测序有什么区别,怎么选择?

A3:根据研究需求来确定适合的方法。Bulk免疫组测序适用于免疫组整体多样性、克隆追踪评估等;单细胞免疫组测序适合与转录组测序联合进行更多基因分析。如需要TCRBCR双链的准确配对,需要选择单细胞免疫组测序,Bulk免疫组测序不能准确配对双链。