单细胞转录组测序

产品描述

案例解析

结果展示

送样须知

Q&A

①技术介绍  

单细胞转录组测序(scRNA-seq)是在单个细胞水平对mRNA进行高通量测序的一项技术,其原理是将样本组织分离成单细胞悬液,并对单个细胞中微量的转录组mRNA进行标记以及高效扩增后进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效破解常规bulk RNA-seq中被掩盖的细胞异质性问题,有助于发现新的细胞类型及其生物学功能,对于深入了解神经生物学研究、免疫学研究、发育生物学研究具有重要意义。

 

②技术路线

 

③分析流程

                              单细胞转录组生信分析流程图

④产品优势

1.项目经验丰富:拥有数百种样本类型单细胞样本处理实操经验,有效保障解离后细胞质量;
2.一站式服务流程:提供从样本解离、单细胞悬液制备、流式分选、磁分选、文库构建,到高通量测序、生信数据分析的完整服务流程;
3.标准化执行流程:实现项目实验与数据分析、报告交付全流程管理,有效提高服务效率(单项目最快15个工作日),保障数据快速交付。

微流控芯片集成血管化子宫内膜复合体:线粒体功能和旁分泌干扰增强再生潜力
研究背景:

子宫内膜损伤是一种常见的妇科疾病,对生育能力和妇女健康构成重大威胁。虽然目前报道的子宫内膜类器官显示出重塑子宫内膜功能的潜力,但它们往往缺乏体内组织的复杂性和生理相关性。
 

技术手段:

将子宫内膜表皮类器官、间质细胞和内皮细胞整合在微流控芯片中,形成一种血管化三细胞子宫内膜复合体,并通过单细胞测序揭示了血管化子宫内膜复合体中的表皮细胞、间质细胞和内皮细胞之间存在双向细胞旁分泌干扰。


 

研究成果:

这些发现揭示了旁分泌的相互作用,支持了血管化三细胞子宫内膜复合体的优越再生特性,为子宫内膜修复提供了潜在的治疗策略,并为子宫内膜病理生理学研究提供了有价值的体外模型
 

参考文献:

Dai Y, Zhao F, Chen Q, et al.Microfluidic chip-integrated vascularized endometrial complexes: Mitochondrial function and paracrine crosstalk enhance regenerative potential. Bioact Mater. 2025 Sep 2;54:551-569. doi: 10.1016/j.bioactmat.2025.08.035.

单细胞转录组测序送样标准
新鲜组织样本:
1.取样:选取关注的组织,尽量剔除与实验无关的杂质,组织体积尽量大于5mm3(黄豆大小),用PBS清洗组织,去除血液等杂质。
2.保存:将清洗好的组织放入2~8℃预冷的装有1.5 mL组织保存液的2 mL冻存管(标明样本编号)中,确保组织完全浸没,置于2~8℃保存。(我司可免费提供组织保存液)
3.运输:将装有组织的冻存管放入自封袋中,用气泡膜包裹,防止样本冻结和运输过程中碰撞损坏,4℃运输。新鲜组织需在离体后48小时内开展实验,请联系销售人员通过快递等方式确保在48小时内送达实验室。
 

体液及细胞悬液样本:
1.取样及保存:

①血液样本取至少4mL,保存在EDTA抗凝管中;

②腹水、胸腔积液等其他体液样本可置于15 mL或50 mL离心管中;

③细胞系样本保存在细胞培养基中运输;

④制备好的细胞悬液可保存在含10%FBS的细胞培养基中。
2.运输:将样本管用气泡膜包裹,4℃运输,血液、体液和细胞系样本在离体后8小时内送达实验室;制备好的细胞悬液在2小时内送达实验室。
 

冻存样本:
1.取样及保存:样本至少为黄豆大小,取到新鲜组织样本后,剔除与实验无关的杂质,用PBS清洗组织去除血液,用吸水纸吸干组织表面水分,将组织置于冻存管中(标明样本编号),后置于液氮中速冻,将速冻后含有组织的冻存管于-80℃冰箱中保存。
2.运输:将装有组织的冻存管放入自封袋中,使用气泡膜包裹,干冰运输,注意将样本完全埋入干冰中。
 

特殊情况:
因特殊原因导致不能将样本运输至我司实验室,我司可上门开展实验,客户需提前与销售人员联系,核对《客户实验室物资清单》,签字确认实验室条件满足实验需求,若不满足实验需求,请补充完整后方可上门。
因特殊原因客户需要将动物带至我司实验室现场取样,我司可提供实验场地配合老师开展实验,如有额外试剂耗材需求,请提前联系销售人员。

Q1:通过10x Genomics平台进行单细胞RNA-Seq的组织样品,是否可以提供前期处理的方法?

A1:我们可以与客户交流前期处理出现的问题,给出相应的建议。

 

Q2:冻存细胞/组织样本寄送前有哪些注意事项?

A2:需要提前与当地项目经理沟通,预约实验日期,提前告知样品送达时间,注意运输温度,防止细胞活性降低。

 

Q3:可以提供上门解离服务吗?

A3:可以上门解离,但需要客户实验室提供离心机、PCR仪等仪器。

 

Q4:请问10x Genomics单细胞RNA-Seq可以进行可变剪切等结构变化分析吗?

A410x Genomics单细胞RNA-Seq产品主要定位为基因表达定量分析为主,数据不建议进行可变剪切等基因结构变化分析。如需研究结构变异信息,可进行单管单细胞RNA测序。

 

Q5:细胞物种没有相应的参考基因组,可以做这个产品吗?

A5:产品分析需要基于一个良好注释和组装的参考序列,基因注释不完善或只注释到转录本,没有注释到基因等的不完善参考序列,会出现占用内存过多,即使对转录本进行去冗余及重新构建,得到的结果可能会不太好,需要客户明确其风险因素。