单细胞免疫组库测序
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Q&A
2015年,10x Genomics发布了基于微流控和油滴包裹技术的Chromium 单细胞系统平台,可实现高通量的单细胞转录组和单细胞V(D)J测序。不但可以将TCR/BCR双链完美匹配,获得TCR/BCR双链组成情况,而且可以细化到单细胞水平,同时获得5’端转录组信息。
10x Genomics新推出的“单细胞免疫谱分析”利用其微流控芯片制备单细胞体系,选择5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集,实现在单细胞水平,对成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)进行全长测序,为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台,对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义。
样本类型
动物组织、血液等其他体液、单细胞悬液、细胞系等。
实验流程

10x Genomics单细胞免疫组库实验流程
分析流程

单细胞VDJ免疫组库生信分析流程图
应用方向
a.抗体的鉴定和新抗体的发现;
b.揭示Ig库的发展,绘制全局Ig库;
c.研究传染性疾病,如感染发展中的抗体进化谱系等;
d.研究免疫失调疾病的V(D)J重组倾向性,寻找免疫失调疾病的生物标记物;
e.癌症早期检测、癌症进程和复发诊断的标记物以及肿瘤免疫机制的研究。
产品优势
a.识别和描述罕见细胞类型和生物标志物;
b.分析组织微环境、疾病进展和药物免疫反应;
c.对新抗原进行大规模抗体和TCR发现
d.通过测量免疫细胞表型来描述对感染的免疫反应;
e.通过大规模单细胞V(D)J+表达谱测序,降低单个细胞成本;
f.提供流式分选服务,实现免疫细胞目的分选。
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